Термінологія, ймовірно, не використовується послідовно, тому далі лише те, як я розумію початкове питання. Наскільки я розумію, звичайні КС, які ви обчислили, - це не те, що просили. Кожен набір реплік завантаження дає один довірчий інтервал, не багато. Спосіб обчислення різних типів CI з результатів набору реплик завантаження полягає в наступному:
B <- 999 # number of replicates
muH0 <- 100 # for generating data: true mean
sdH0 <- 40 # for generating data: true sd
N <- 200 # sample size
DV <- rnorm(N, muH0, sdH0) # simulated data: original sample
Оскільки я хочу порівнювати обчислення з результатами пакету boot
, я спочатку визначаю функцію, яка буде викликана для кожної копії. Його аргументами є оригінальний зразок та індексний вектор, що вказує випадки на одну репліку. Він повертає , оцінку плагіну для , а також , оцінку плагіна для дисперсії середнього значення . Останнє знадобиться лише для завантажувальної програми -CI. μ S 2 ⋆ M σ 2 M tМ⋆мкS2 ⋆Мσ2Мт
> getM <- function(orgDV, idx) {
+ bsM <- mean(orgDV[idx]) # M*
+ bsS2M <- (((N-1) / N) * var(orgDV[idx])) / N # S^2*(M)
+ c(bsM, bsS2M)
+ }
> library(boot) # for boot(), boot.ci()
> bOut <- boot(DV, statistic=getM, R=B)
> boot.ci(bOut, conf=0.95, type=c("basic", "perc", "norm", "stud"))
BOOTSTRAP CONFIDENCE INTERVAL CALCULATIONS
Based on 999 bootstrap replicates
CALL :
boot.ci(boot.out = bOut, conf = 0.95, type = c("basic", "perc", "norm", "stud"))
Intervals :
Level Normal Basic Studentized Percentile
95% ( 95.6, 106.0 ) ( 95.7, 106.2 ) ( 95.4, 106.2 ) ( 95.4, 106.0 )
Calculations and Intervals on Original Scale
Без використання пакету boot
ви можете просто скористатися, replicate()
щоб отримати набір реплік для завантаження.
boots <- t(replicate(B, getM(DV, sample(seq(along=DV), replace=TRUE))))
Але давайте дотримуватимемося результатів, boot.ci()
щоб мати посилання.
boots <- bOut$t # estimates from all replicates
M <- mean(DV) # M from original sample
S2M <- (((N-1)/N) * var(DV)) / N # S^2(M) from original sample
Mstar <- boots[ , 1] # M* for each replicate
S2Mstar <- boots[ , 2] # S^2*(M) for each replicate
biasM <- mean(Mstar) - M # bias of estimator M
Основні, перцентильні та -CI покладаються на емпіричний розподіл оцінок завантаження. Для отримання та , ми знаходимо відповідні індекси до відсортованого вектора оцінок завантажувального коду (зауважте, що буде зроблено складнішу інтерполяцію для пошуку емпіричних квантилів, коли індекси не є натуральними числами) .α / 2 1 - α / 2тα / 21 - α / 2boot.ci()
(idx <- trunc((B + 1) * c(0.05/2, 1 - 0.05/2)) # indices for sorted vector of estimates
[1] 25 975
> (ciBasic <- 2*M - sort(Mstar)[idx]) # basic CI
[1] 106.21826 95.65911
> (ciPerc <- sort(Mstar)[idx]) # percentile CI
[1] 95.42188 105.98103
Для -CI нам потрібні оцінки завантаження для обчислення критичних значень. Для стандартної нормальної CI критичним значенням буде просто -значення від стандартного нормального розподілу.t ⋆ t zтт⋆тz
# standard normal CI with bias correction
> zCrit <- qnorm(c(0.025, 0.975)) # z-quantiles from std-normal distribution
> (ciNorm <- M - biasM + zCrit * sqrt(var(Mstar)))
[1] 95.5566 106.0043
> tStar <- (Mstar-M) / sqrt(S2Mstar) # t*
> tCrit <- sort(tStar)[idx] # t-quantiles from empirical t* distribution
> (ciT <- M - tCrit * sqrt(S2M)) # studentized t-CI
[1] 106.20690 95.44878
Для того, щоб оцінити ймовірність покриття цих типів CI, вам доведеться запускати це моделювання багато разів. Просто загорніть код у функцію, поверніть список із результатами CI і запустіть його, replicate()
як показано в цьому суті .
size=100
друкарський помилок? Я не вірю, що ви отримуєте правильну верхню та нижню межі, оскільки неявний розмір вибірки становить 1000, коли ви обчислюєте свої CI в циклі (оскільки ви використовуєтеsqrt.n
для обчислення). Крім того, чому ви порівнюєте з,mu
а не 0 безпосередньо (останній є справжньою середньою)?