Ось одна інтерпретація вашого запитання, яку ви можете, а може і не планували, але на яку я маю відповідь.
Комп'ютери, очевидно, справжні фізичні пристрої, і тому їх можна моделювати за законами фізики. Але ми не використовуємо закони фізики, які були б необхідні для опису реального комп'ютера як моделі обчислення, оскільки він занадто складний. Щоб зробити модель обчислення, ми визначимо щось на кшталт машини Тьюрінга, яка є достатньо простою для математичного відстеження. Однак зараз ми зв'язали модель з фізичного світу, оскільки ми не кажемо, як побудована машина Тьюрінга або які сили примушують її працювати.
Тож чи можемо ми розробити кілька простих моделей, які фіксують «обчислення», але основні правила яких мають фізичний характер? Моєю відповіддю на це було б ознайомитись з лекціями Фейнмана з обчислень: http://www.amazon.com/Feynman-Lectures-Computation-Richard-P/dp/0738202967
Він розповідає про безліч різних простих фізичних систем, які проводять обчислення. Наприклад, існує модель більярдної кулі Фредкіна та Тоффолі (http://en.wikipedia.org/wiki/Billiard-ball_computer), де справа полягала в тому, щоб чітко враховувати енергетичні потреби та створити комп'ютер, на який можна працювати. довільно багато кроків для довільно мало енергії. Зокрема, у главі про оборотні обчислення є багато таких прикладів.
Ми багато думаємо над цим питанням у своїй лабораторії. Наприклад, ми провели певну роботу над тим, що означає обчислення мереж хімічних реакцій: http://www.dna.caltech.edu/DNAresearch_publications.html#DeterministicCRNs та http://www.dna.caltech.edu /DNAresearch_publications.html#ComputationalCRN
Ми також роздумуємо над тим, як утворення насінних кристалів може проводити обчислення: http://www.dna.caltech.edu/DNAresearch_publications.html#Simulations , а також насправді намагається зробити це експериментальним шляхом: http: //www.dna.caltech .edu / DNAresearch_publications.html # OrigamiSeed та деякі інші роботи, засновані на обчисленнях з використанням фізичного явища, званого переміщенням ланцюга ДНК: http://www.dna.caltech.edu/DNAresearch_publications.html#DNALogicCircuits