Запитання з тегом «computational-biology»

Моє передумови в геноміці, але останнім часом я працюю з проблемами, пов’язаними зі структурою білка. Я написав декілька відповідних програм на C, будуючи власний аналізатор файлів PDB з нуля в процесі. Я не турбувався про те, щоб зробити дійсно надійний аналізатор, я просто знав, що побудова одного себе буде найкращим …

17 computational-biology  pdb  c 

Я досить багато працюю в математичній біології / епідеміології, де більшість робіт з моделювання / обчислювальної науки досі переважають набори ОДЕ, правда, іноді досить складні набори з них. Одним із плюсів цих моделей є те, що їх досить легко описати та повторити. Таблиця значень параметрів та самих рівнянь, і ви …

14 ode  computational-biology 

Я намагався скласти біологічно точну 2D просторову модель тканинних шарів, де відбуваються різні фізіологічні процеси. Це включає в основному хімічні реакції, дифузію та потоки через межі. Я виготовляю цю модель в COMSOL Multiphysics, програмному пакеті з кінцевими елементами, який вирішує різні фізики, як системи реакції-дифузії, хоча для мого питання це …

10 finite-element  comsol  computational-biology 

У мене є система звичайних диференціальних рівнянь - 7 рівнянь і ~ 30 параметрів, що регулюють їх поведінку як частина математичної моделі передачі захворювання. Я б хотів , щоб знайти стійкі стану для цих рівнянь Changing dx/dt = rest of the equationдля 0 = equationкожного з рівнянь робить просту проблему …

9 ode  symbolic-computation  computational-biology