Я аналізую дані відстеження очей із розробленого експерименту. Спрощена версія моїх даних виглядає приблизно так (дані dput () можна отримати тут ),
head(lookDATA)
participant fixationImage fixationCount
1 9 Automobile 81
2 9 Bird 63
3 9 Chair 82
4 9 Dog 64
5 9 Face 90
6 9 Plant 75
де учасник є унікальним ідентифікатором для кожного предмета, fixationImage - це категорія зображення, яку вони зафіксували, а fixationCount - кількість разів, яку вони фіксували на цій категорії зображення.
Я підключаю модель пуассона до даних, використовуючи glmer () з пакету lme4 .
model<-glmer(fixationCount ~ fixationImage + (1|participant), family = poisson, data = lookDATA)
Я використовував lsmeans () з пакету lsmeans, щоб вивчити відмінності між рівнями факторів,
cld(lsmeans(model,"fixationImage"))
який забезпечує наступний вихід:
fixationImage lsmean SE df asymp.LCL asymp.UCL .group
Chair 3.786022 0.05764923 NA 3.673018 3.899026 1
Bird 3.866201 0.05750641 NA 3.753476 3.978925 2
Dog 3.868768 0.05751010 NA 3.756037 3.981500 2
Body 3.883644 0.06040952 NA 3.765230 4.002059 23
Plant 3.893327 0.05746744 NA 3.780679 4.005975 23
Automobile 3.901939 0.05745528 NA 3.789315 4.014563 23
Face 3.946848 0.05832549 NA 3.832519 4.061178 3
Згідно з моїм (можливо, обмеженим) розумінням використання віньетки lsmeans, стовпчик lsmean повинен представляти середню кількість переглядів для даної категорії, передбаченої моделлю.
Однак ці значення здаються незручно далекими від простої описової статистики для цих чисел,
summaryBy(fixationCount ~ fixationImage, data = lookDATA)
fixationImage fixationCount.mean
1 Automobile 55.18750
2 Bird 53.25000
3 Body 57.12821
4 Chair 50.39450
5 Dog 53.82883
6 Face 56.76389
7 Plant 54.71429
припустивши, що я неправильно розумію, що тут представляють lsmeans, або, можливо, я неправильно уточнив модель.
Будь-яка допомога буде дуже вдячна.
$<-.data.frame
(*tmp*
, "sep", value = ","): заміна має 1 рядок, дані мають 0. Для запису я використовую R версії 3.1.2 (2014-10-31) 'Гарбузовий шолом' та lsmeans версії 2.17. Тим не менш, ти відповів на моє запитання, і я перетворять вихід вручну. Знову дякую!