Суперечливі результати суми квадратів III типу в ANOVA в SAS та R


15

Я аналізую дані незбалансованого факторного експерименту як з, так SASі з R. Обидва SASі Rзабезпечують подібну суму квадратів I типу, але їх квадрати III типу відрізняються одна від одної. Нижче наведені SASі Rкоди і виходи.

DATA ASD;
INPUT Y T B;
DATALINES;
 20 1 1
 25 1 2
 26 1 2
 22 1 3
 25 1 3
 25 1 3
 26 2 1
 27 2 1
 22 2 2
 31 2 3
;

PROC GLM DATA=ASD;
CLASS T B;
MODEL Y=T|B;
RUN;

Тип I SS від SAS

Source  DF       Type I SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     17.06666667     17.06666667       9.75    0.0354
B       2     12.98000000      6.49000000       3.71    0.1227
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

Тип III СС від SAS

Source  DF     Type III SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     23.07692308     23.07692308      13.19    0.0221
B       2     31.05333333     15.52666667       8.87    0.0338
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

R код

Y <- c(20, 25, 26, 22, 25, 25, 26, 27, 22, 31)
T <- factor(x=rep(c(1, 2), times=c(6, 4)))
B <- factor(x=rep(c(1, 2, 3, 1, 2, 3), times=c(1, 2, 3, 2, 1, 1)))
Data <- data.frame(Y, T, B)
Data.lm <- lm(Y~T*B, data = Data)
anova(Data.lm)
drop1(Data.lm,~.,test="F") 

Тип I SS від R

Analysis of Variance Table

Response: Y
          Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
T          1 17.067  17.067  9.7524 0.03543 *
B          2 12.980   6.490  3.7086 0.12275  
T:B        2 47.853  23.927 13.6724 0.01629 *
Residuals  4  7.000   1.750                  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Тип III СС від R

Single term deletions

Model:
Y ~ T * B
       Df Sum of Sq    RSS     AIC F value  Pr(>F)  
<none>               7.000  8.4333                  
T       1    28.167 35.167 22.5751 16.0952 0.01597 *
B       2    20.333 27.333 18.0552  5.8095 0.06559 .
T:B     2    47.853 54.853 25.0208 13.6724 0.01629 *
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Я щось тут пропускаю? Якщо ні, то який правильний тип III SS?


Відповіді:


29

Тип III SS залежить від використовуваної параметризації. Якщо я встановлю

  options(contrasts=c("contr.sum","contr.poly"))

перед запуском, lm()і тоді drop1()я отримую точно такий же тип III SS, як і SAS. Для догми R-спільноти з цього питання ви повинні прочитати « Ексегези Венебла» на лінійних моделях .

Дивіться також: Як можна зробити тип AN III SS-III типу R з контрастними кодами?


1
@Peter Якщо ви думаєте, що це може вмістити коментар, чому б ні. Я не думаю, так чому б не задати нове запитання (і посилання на це)?
chl

1
@chl Моя основна думка в тому , що основні ефекти дійсно мають сенс при наявності взаємодій , вони - ефект , коли інша змінна дорівнює 0. Часто це має сенс. Не впевнений, що варто ціла нитка.
Пітер Флом - Відновити Моніку

3
Я погоджуюся, що є ситуації, коли основні наслідки можна інтерпретувати - Venables займає дуже сильну лінію, - але є багато ситуацій, коли вони важкі. Я думаю, що "не роби цього, якщо ти не знаєш, що ти робиш" - це розумне налаштування за замовчуванням ...
Бен Болкер,

1
Чи змінить наступні контрасти до стандарту R? options(contrasts=c("contr.treatment", "contr.poly"))
Расмус Ларсен

1
так ...........
Бен Болкер
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.