Запитання з тегом «glmm»

Я намагаюся зрозуміти, коли використовувати випадковий ефект і коли це зайве. Мені сказали, як правило, якщо у вас є 4 або більше груп / осіб, які я роблю (15 окремих лосів). Деякі з цих лосів експериментували 2 або 3 рази протягом загальної кількості 29 випробувань. Я хочу знати, чи поводяться …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Мені цікаво, чим відрізняються змішані та не змішані GLM. Наприклад, у SPSS випадаюче меню дозволяє користувачам підходити або до: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Чи по-різному вони мають справу з відсутніми значеннями? Моя залежна змінна є двійковою, і у мене є кілька …

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

В даний час я борюся з пошуком правильної моделі для складних підрахунків даних (залежна змінна). Я спробував різні моделі (для моїх даних потрібні моделі змішаних ефектів), таких як lmerі lme4(з перетворенням журналу), а також узагальнені лінійні змішані ефекти з різними сімействами, такими як гауссова або негативна двочлен. Однак я зовсім …

25 generalized-linear-model  residuals  negative-binomial  count-data  glmm 

Ми виконали логістичну регресію зі змішаними ефектами, використовуючи наступний синтаксис; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Тема та предмет - випадкові ефекти. Ми отримуємо непарний результат, який є коефіцієнтом і стандартним відхиленням для предмета, …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

У мене є експеримент повторного вимірювання, де залежна змінна є відсотком, і я маю кілька факторів як незалежних змінних. Я хотів би використати glmerз пакету R lme4трактувати це як проблему логістичної регресії (шляхом уточнення family=binomial), оскільки, здається, це вміщення безпосередньо відповідає. Мої дані виглядають так: > head(data.xvsy) foldnum featureset noisered …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

У мене є GLMM з біноміальним розподілом і функцією logit-ланки, і я маю відчуття, що важливий аспект даних недостатньо добре представлений в моделі. Щоб перевірити це, я хотів би знати, чи добре дані описуються лінійною функцією за шкалою logit. Отже, я хотів би дізнатись, чи добре себе почувають залишки. Однак …

19 binomial  residuals  glmm  lme4-nlme 

Я використовую glmerфункцію з lme4пакету в R, і я використовую bobyqaоптимізатор (тобто за замовчуванням у моєму випадку). Я отримую попередження, і мені цікаво, що це означає. Warning message: In optwrap(optimizer, devfun, start, rho$lower, control = control, : convergence code 3 from bobyqa: bobyqa -- a trust region step failed to …

16 r  optimization  lme4-nlme  convergence  glmm 

Я намагаюся використати lme4::glmer()для встановлення біноміальної узагальненої змішаної моделі (GLMM) із залежною змінною, яка є не бінарною, а суцільною змінною між нулем та одиницею. Можна вважати цю змінну як ймовірність; насправді це ймовірність того, як повідомили людських суб'єктів (в експерименті , який я допомогти аналізує). Тобто це не "дискретна" частка, …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

У мене є набір даних, в якому змінна, яку я хотів би використовувати як випадковий ефект, має лише одне спостереження для деяких рівнів. На основі відповідей на попередні запитання я зібрав, що в принципі це може бути добре. Чи можу я відповідати змішаній моделі з предметами, які мають лише 1 …

14 r  mixed-model  generalized-linear-model  glmm  lme4-nlme 

Я запускаю логістичну регресійну модель у вигляді: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Зазвичай я б обчислював ICC за перехопленнями та залишковими відхиленнями, але резюме моделі не містить залишкової дисперсії. Як я обчислюю це?

13 logistic  lme4-nlme  glmm 

Я зіткнувся з низкою практичних питань, коли моделював підрахунок даних експериментальних досліджень за допомогою експерименту в рамках предмета. Я коротко описую експеримент, дані та те, що я зробив до цього часу, після чого мої питання Чотири різних фільми були показані на вибірці респондентів послідовно. Після кожного фільму було проведено інтерв'ю, …

12 generalized-linear-model  negative-binomial  glmm  poisson-regression  overdispersion 

У мене є така модель: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... і це підсумок. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 Random …

12 r  poisson-distribution  lme4-nlme  glmm  overdispersion 

У пошуку будь-якої інформації про граничну модель та модель випадкових ефектів та про те, як вибрати між ними, я знайшов деяку інформацію, але це було більш-менш математичне абстрактне пояснення (як, наприклад, тут: https: //stats.stackexchange .com / a / 68753/38080 ). Десь я виявив, що між цими двома методами / моделями …

11 mixed-model  random-effects-model  glmm  gee  marginal-model 

У мене є випадкова логістична регресія перехоплення (за рахунок повторних вимірювань), і я хотів би провести деяку діагностику, зокрема стосовно людей, що перебувають у спокої та впливових спостережень. Я подивився на залишки, щоб побачити, чи існують спостереження. Але я також хотів би поглянути на щось на кшталт відстані Кука або …

11 mixed-model  outliers  glmm  cooks-distance 

Я сподіваюся, що хтось може допомогти у тому, що, на мою думку, є відносно простим питанням, і я думаю, що знаю відповідь, але без підтвердження це стало чимось, в чому я просто не можу бути впевненим. У мене є деякі дані підрахунку як змінної відповіді, і я хочу виміряти, як …

11 r  binomial  proportion  glmm  lme4-nlme