Обчислювальна наука

Хтось має рекомендації щодо швидкодіючої бібліотеки матриць C ++? Що я маю на увазі під придатним, це наступне: Об'єкти матриці мають інтуїтивний інтерфейс (напр .: я можу використовувати рядки та стовпці під час індексації) Я можу зробити все, що стосується класу матриць, що я можу зробити з LAPACK та BLAS …

158 linear-algebra  software  implicit-methods 

Я переконаний у цінності використання тестів, що підтверджують повну програму (наприклад, тести конвергенції), включаючи автоматизований набір тестів регресії . Прочитавши деякі книги програмування, у мене з'явилося нудне відчуття, що я "повинен" написати одиничні тести (тобто тести, які підтверджують правильність однієї функції і не мають значення для виконання всього коду для …

89 programming-paradigms  testing 

Тож у мене є гідна голова щодо того, які проблеми, з якими я працюю, найкращі в серіалі, і з якими можна керуватися паралельно. Але зараз я не маю великого уявлення про те, що найкраще справляється з обчисленнями на базі процесора, і що слід завантажувати в GPU. Я знаю, що це …

84 gpu 

У мене є декілька складних проблем, що стосуються невипуклої глобальної оптимізації. В даний час я використовую панель інструментів оптимізації MATLAB (конкретно, fmincon()з алгоритмом = 'sqp'), що є досить ефективним . Однак більша частина мого коду знаходиться в Python, і я хотів би зробити оптимізацію і в Python. Чи є розв'язувач …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Це питання є продовженням двох дискусій, які нещодавно з'явилися у відповідях на " C ++ проти Fortran для HPC ". І це трохи більше виклику, ніж питання ... Один з найбільш часто почутих аргументів на користь Fortran - це те, що компілятори просто кращі. Оскільки більшість компіляторів C / Fortran …

74 fortran  c  blas  benchmarking 

Я працюю в обчислювальній науці, і, як результат, витрачаю нетривіальну кількість свого часу, намагаючись збільшити наукову пропускність багатьох кодів, а також розуміючи ефективність цих кодів. Припустимо, я оцінив компроміс продуктивності та читабельності / повторної використання / ремонтопридатності програмного забезпечення, над яким я працюю, і вирішив, що настав час піти на …

66 performance 

У моїй докторській програмі з обчислювальної науки ми працюємо майже виключно в C ++ та Fortran. Схоже, деякі професори віддають перевагу одному над іншим. Мені цікаво, хто з них «кращий» або якщо за певних обставин один кращий за інший.

56 hpc  fortran  c++  languages 

Перетворення Фур'є Швидкий алгоритм обчислює розкладання Фур'є в припущенні , що його вхідні точки рівномірно розподілені в області часу, . Що робити, якщо їх немає? Чи є інший алгоритм, який я міг би використовувати, або я можу змінити FFT, щоб врахувати, що фактично є змінною швидкістю вибірки?tk=kTtk=kTt_k = kT Якщо …

55 fourier-analysis 

Я розглядаю вивчення нової мови для використання для чисельних / імітаційних моделюючих проектів, як (часткову) заміну для C ++ та Python, якими я зараз користуюся. Я натрапив на Джулію , яка звучить наче ідеально. Якщо він виконує все, на що претендує, я міг би використовувати його для заміни як C …

55 parallel-computing  languages  julia 

Багато наукових чисельних алгоритмів (інтеграція, диференціювання, інтерполяція, спеціальні функції тощо) доступні в наукових бібліотеках обчислень, таких як GSL . Але я часто бачу код із "рулонними" реалізаціями цих функцій. Для невеликих програм, які не обов'язково призначені для публічного розповсюдження, чи є загальною практикою серед науковців-обчислювачів просто застосовувати чисельні алгоритми (під …

54 libraries  c 

Кожному вченому потрібно трохи знати статистику: що означає кореляція, що таке довірчий інтервал тощо. Аналогічно, кожен учений повинен трохи знати про обчислення: питання в тому, що? Що розумно очікувати від кожного працюючого вченого про створення та використання програмного забезпечення? Наш перелік основних навичок --- те, що люди повинні знати, перш …

52 education 

Рідкі лінійні системи з'являються із збільшенням частоти в додатках. Для вирішення цих систем можна вибрати багато підпрограм. На найвищому рівні існує водорозділ між прямим (наприклад, розрідженим гауссовим усуненням або розкладанням Холеського, із спеціальними алгоритмами впорядкування та мультифронтальними методами) та ітераційними (наприклад, GMRES, (дво-) спряжений градієнт) методами. Як можна визначити, чи …

49 linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix 

Існує очевидна різниця між скінченною різницею і методом кінцевих обсягів (перехід від визначення точки рівнянь до інтегральних середніх значень по осередках). Але я вважаю, що FEM і FVM дуже схожі; вони обидва використовують цілісну форму і середню за клітинами. Що робить метод FEM, що FVM не є? Я прочитав невелику …

48 finite-element  finite-volume 

Я звик думати про кінцеві відмінності як про особливий випадок скінченних елементів на дуже обмеженій сітці. Отже, які умови щодо вибору методу скінченної різниці (FDM) та методу кінцевих елементів (FEM) як числового методу? Що стосується методу скінченних різниць (FDM), можна вважати, що вони концептуально простіші та простіші у застосуванні, ніж …

46 pde  finite-element 

Багато разів, коли я успадковував чи стикався з науковим кодом, написаним іншими людьми (або зрідка, навіть моєю власною роботою), я помічав, що документація є рідкісною або взагалі не існує. Якщо мені пощастило, я бачу інформативні коментарі. Якщо мені дуже пощастило, є навіть коментарі Doxygen та Doxyfile, так що я маю …

44 software  documentation