Запитання з тегом «lme4-nlme»

Я намагаюся встановити багатоваріантну (тобто множину реакцій) змішану модель R. Окрім пакунків ASReml-rта SabreRпакунків (для яких потрібне зовнішнє програмне забезпечення), здається, це можливо лише в MCMCglmm. У статті, що додається до MCMCglmmпакету (с. 6), Джаррод Хадфілд описує процес встановлення такої моделі, як переформатування декількох змінних відповідей в одну змінну довгого …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression 

Я щойно читав (пере) читав "Гельман", чому нам (як правило) не потрібно турбуватися про багаторазове порівняння . Зокрема, у розділі "Кілька результатів та інші виклики" згадується використання ієрархічної моделі для ситуацій, коли в одній особі / підрозділі є різні пов'язані заходи в різні періоди / умови. Схоже, він має ряд …

10 multiple-comparisons  multilevel-analysis  lme4-nlme  jags  hierarchical-bayesian 

Структура даних > str(data) 'data.frame': 6138 obs. of 10 variables: $ RT : int 484 391 422 516 563 531 406 500 516 578 ... $ ASCORE : num 5.1 4 3.8 2.6 2.7 6.5 4.9 2.9 2.6 7.2 ... $ HSCORE : num 6 2.1 7.9 1 6.9 8.9 …

10 r  mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme 

Я хочу моделювати дві різні змінні часу, деякі з яких сильно колінеарні в моїх даних (вік + когорта = період). Роблячи це, у мене виникли проблеми з lmerвзаємодією та взаємодією poly(), але, мабуть, це не обмежується lmer, я отримав однакові результати з nlmeIIRC. Очевидно, що мого розуміння того, що робить …

10 r  lme4-nlme  polynomial 

Я закінчую аналіз на великому наборі даних. Я хотів би взяти лінійну модель, використану в першій частині роботи, і перевстановити її за допомогою лінійної змішаної моделі (LME). LME був би дуже схожим за винятком того, що одна із змінних, що використовуються в моделі, буде використовуватися як випадковий ефект. Ці дані …

10 r  regression  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Це скоріше концептуальне запитання, але в міру використання Rя буду посилатися на пакунки в R. Якщо мета полягає у встановленні лінійної моделі для прогнозування, а потім робити прогнози, коли випадкові ефекти можуть бути недоступні, чи є користь від використання моделі змішаних ефектів, чи слід використовувати замість неї модель з фіксованим …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

Я аналізую дані відстеження очей із розробленого експерименту. Спрощена версія моїх даних виглядає приблизно так (дані dput () можна отримати тут ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9 Plant 75 …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme 

Я аналізую деякі поведінкові дані, використовуючи, lme4в Rосновному дотримуючись чудових навчальних посібників Bodo Winter , але я не розумію, чи правильно обробляю взаємодію. Гірше, що ніхто більше не бере участь у цьому дослідженні, не використовує змішаних моделей, тому я трохи похитнувся, коли потрібно переконатися, що все правильно. Замість того, щоб …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Яка структура дисперсії-коваріації за замовчуванням для випадкових ефектів у пакеті glmerчи lmerв ньому lme4? Як можна вказати іншу структуру коваріації дисперсії для випадкових ефектів у коді? Я не зміг знайти жодної інформації щодо цього в lme4документації.

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Я відчуваю себе переповненим після спроби зануритися в літературу про те, як запустити мішаний аналіз моделі після його використання з використанням AIC для вибору найкращої моделі чи моделі. Я не думаю, що мої дані є настільки складними, але я шукаю підтвердження того, що те, що я зробив, є правильним, а …

10 r  lme4-nlme  random-effects-model  aic 

Вступ У мене є учасники, які неодноразово торкаються забруднених поверхонь кишковою паличкою за двох умов ( А = носіння рукавичок, В = рукавички відсутні). Хочу знати, чи є різниця між кількістю бактерій на кінчиках пальців із рукавичками та без них, а також між кількістю контактів. Обидва фактори є всередині учасника. …

9 r  anova  repeated-measures  lme4-nlme  glmm 

Не настільки рідкісне явище при роботі зі складними максимально змішаними моделями (оцінка всіх можливих випадкових ефектів для даних та моделі) є ідеальним (+1 або -1) або майже ідеальним співвідношенням між деякими випадковими ефектами. З метою обговорення, дотримуйтесь наступної моделі та резюме моделі Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # Y …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

У мене є деякі питання щодо специфікації та інтерпретації GLMM. 3 питання, безумовно, статистичні, а 2 - конкретніше про Р. Я публікую тут, оскільки, зрештою, я думаю, що це інтерпретація результатів ГЛМ. На даний момент я намагаюся вписатись в GLMM. Я використовую дані перепису США з Бази даних про поздовжні …

9 r  lme4-nlme  poisson-distribution  negative-binomial  glmm 

Мені підходить модель змішаних ефектів із терміном сплайна в додатку, де тенденція з часом є криволінійною. Однак те, що я хотів би оцінити, - чи виникає крива-лінійна тенденція через індивідуальне відхилення від лінійності, чи це вплив на рівні групи, який робить груповий рівень придатним, здається криволінійним. Я наводжу відтворювальний приклад, …

9 r  splines  lme4-nlme 

Я використовую lmer в R, щоб перевірити вплив умови ( cond) на деякий результат. Ось деякі складені дані, де s є предметом ідентифікатора і a, bі cє умовами. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), c = rnorm(30, …

9 r  lme4-nlme  contrasts