Запитання з тегом «meta-analysis»

У мене є два набори даних із досліджень, пов'язаних з геномом. Єдина доступна інформація - коефіцієнт шансів і значення р для першого набору даних. Для другого набору даних я маю коефіцієнт коефіцієнта, p-значення та частоти алелей (AFD = хвороба, AFC = управління) (наприклад: 0,321). Я намагаюся зробити метааналіз цих даних, …

10 meta-analysis  genetics 

Я провожу багаторівневий метааналіз, який включає деякі статті з множинними результатами. Тому я використовую цю rma.mv()функцію. Приклад коду: test.main = rma.mv(yi,vi,random = ~1|ID, data = data) У мене є два питання: Я прочитав в попередньому запиті , що при використанні rma.mv(), ranktest()не є надійним тест воронки ділянки асиметрії. Однак, якщо …

9 meta-analysis  sensitivity-analysis  publication-bias  funnel-plot 

Я працюю над метааналізом випадкових ефектів, що охоплює ряд досліджень, які не повідомляють про стандартні відхилення; у всіх дослідженнях робиться звіт про розмір вибірки. Я не вірю, що неможливо наблизити або замінити відсутні дані SD. Як має бути мета-аналіз, який використовує необроблені (нестандартні) середні відмінності як розмір ефекту, зважився, коли …

9 stata  missing-data  meta-analysis  meta-regression 

Я провожу мета-аналіз розмірів ефектів d в R за допомогою пакету metafor. d представляє відмінності в показниках пам’яті між пацієнтами та здоровими. Однак деякі дослідження повідомляють лише про підряди міри, що цікавлять d (наприклад, кілька різних балів пам'яті або балів з трьох окремих блоків тестування пам'яті). Будь ласка, дивіться наступний …

9 r  meta-analysis  effect-size  meta-regression 

Припустимо, ми хочемо зробити висновок про неспостережувану реалізацію випадкової величини , яка зазвичай розподіляється середнім та дисперсією . Припустимо, є ще одна випадкова величина (незабезпеченою реалізацією якої ми також будемо називати ), яка зазвичай розподіляється із середнім та дисперсією . Нехай \ sigma_ {xy} - коваріація \ tilde x і …

9 meta-analysis 

Скажімо, я роблю аналіз, дивлячись на конкретний стан здоров'я. Мене цікавить різниця в тій мірі між пацієнтами та контрольними групами, і чи відрізняється різниця від 0. У минулому були проведені дослідження, що розглядали мій той самий дослідницький питання та міру здоров’я, але в різних зразках пацієнтів. У своєму байєсівському аналізі …

9 bayesian  meta-analysis  case-control-study 

Наступні трансплантати взяті з цієї статті . Я новачок у завантажувальній програмі та намагаюся реалізувати параметричне, напівпараметричне та непараметричне завантажувальне завантаження для лінійної змішаної моделі з R bootпакетом. R код Ось мій Rкод: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + (1|Block) + (1|Cult), data=Cultivation) fixef(fm1Cult) boot.fn …

9 r  mixed-model  bootstrap  central-limit-theorem  stable-distribution  time-series  hypothesis-testing  markov-process  r  correlation  categorical-data  association-measure  meta-analysis  r  anova  confidence-interval  lm  r  bayesian  multilevel-analysis  logit  regression  logistic  least-squares  eda  regression  notation  distributions  random-variable  expected-value  distributions  markov-process  hidden-markov-model  r  variance  group-differences  microarray  r  descriptive-statistics  machine-learning  references  r  regression  r  categorical-data  random-forest  data-transformation  data-visualization  interactive-visualization  binomial  beta-distribution  time-series  forecasting  logistic  arima  beta-regression  r  time-series  seasonality  large-data  unevenly-spaced-time-series  correlation  statistical-significance  normalization  population  group-differences  demography 

У мене є два набори даних із досліджень, пов'язаних з геномом. Єдиною доступною інформацією є непарні коефіцієнти та їх довірчі інтервали (95%) для кожного генотипованого SNP. Я хочу створити лісову ділянку, порівнюючи ці два коефіцієнти шансів, але я не можу знайти спосіб обчислити комбіновані довірчі інтервали для візуалізації підсумкових ефектів. …

9 confidence-interval  meta-analysis  genetics  odds-ratio 

Мені знайомі методи мета-аналізу та metaforметарегресії (використовуючи пакет R від Viechtbauer), але я нещодавно натрапив на проблему, яку я не можу легко вирішити. Скажімо, у нас є захворювання, яке може перейти від матері до ненародженої дитини, і воно вивчалося вже неодноразово. Мати і дитина були випробувані на вірус відразу після …

9 meta-analysis  odds-ratio  relative-risk