Запитання з тегом «mixed-model»

Нещодавно мені сказали, що неможливо включити коваріати, що змінюються за часом, в поздовжні змішані моделі без введення часових затримок для цих коріаріатів. Чи можете ви підтвердити / спростувати це? Чи є у вас якісь посилання на цю ситуацію? Я пропоную просту ситуацію для уточнення. Припустимо, я повторив заходи (скажімо, більше …

12 r  mixed-model  lme4-nlme 

Мені було цікаво, чи існують якісь методи машинного навчання (без нагляду) для моделювання поздовжніх даних? Я завжди використовував моделі змішаних ефектів (переважно нелінійні), але мені було цікаво, чи існують інші способи цього (за допомогою машинного навчання). Під машинним навчанням я маю на увазі випадковий ліс, класифікацію / кластеризацію, дерева рішень …

11 machine-learning  mixed-model 

Я читаю теоретичний документ Дуга Бейтса про пакет lme4 R для того, щоб краще зрозуміти складність і змішаність моделей, і натрапив на інтригуючий результат, який я хотів би зрозуміти краще, щодо використання обмеженої максимальної ймовірності (REML) для оцінки дисперсії . У розділі 3.3 щодо критерію REML він зазначає, що використання …

11 maximum-likelihood  mixed-model  unbiased-estimator  hierarchical-bayesian  reml 

Я підходив до lmer-моделі із наступним (хоча і складеним результатом): Random effects: Groups Name Std.Dev. day:sample (Intercept) 0.09 sample (Intercept) 0.42 Residual 0.023 Я дуже хотів би побудувати інтервал довіри для кожного ефекту, використовуючи наступну формулу: (n−1)s2χ2α/2,n−1,(n−1)s2χ21−α/2,n−1(n−1)s2χα/2,n−12,(n−1)s2χ1−α/2,n−12 \frac{(n-1)s^2}{\chi^2_{\alpha/2, n-1}},\frac{(n-1)s^2}{\chi^2_{1-\alpha/2,n-1}} Чи є спосіб зручно дістати ступеня свободи?

11 lme4-nlme  mixed-model 

Я намагаюся вказати формулу для лінійної моделі змішаного ефекту (з lme4) для моєї експериментальної конструкції, але я не впевнений, що я роблю це правильно. Конструкція: в основному я вимірюю параметр відгуку на рослинах. У мене 4 рівні лікування та 2 рівні поливу. Рослини згруповані в 16 ділянок, в межах кожної …

11 r  experiment-design  mixed-model 

Моє запитання засноване на цій відповіді, яка показала, яка lme4::lmerмодель відповідає двостороннім повторним заходам ANOVA: require(lme4) set.seed(1234) d <- data.frame( y = rnorm(96), subject = factor(rep(1:12, 4)), a = factor(rep(1:2, each=24)), b = factor(rep(rep(1:2, each=12))), c = factor(rep(rep(1:2, each=48)))) # standard two-way repeated measures ANOVA: summary(aov(y~a*b+Error(subject/(a*b)), d[d$c == "1",])) # …

11 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Розглянемо випадкову лінійну модель перехоплення. Це еквівалентно лінійній регресії GEE зі змінною робочою матрицею кореляції. Припустимо , що предиктори і і коефіцієнти для цих провісників є , і . Яка інтерпретація коефіцієнтів у моделі випадкового перехоплення? Це те саме, що лінійна регресія GEE, за винятком того, що вона знаходиться на …

11 mixed-model 

Я шукаю поради щодо аналізу складних даних опитування з багаторівневими моделями в Р. Я використовував surveyпакет для зважування для неоднакових ймовірностей вибору в однорівневих моделях, але цей пакет не має функцій для багаторівневого моделювання. lme4Пакет відмінно підходить для багаторівневого моделювання, але це не так , що я знаю , щоб …

11 r  mixed-model  weighted-sampling  cluster-sample 

У пошуку будь-якої інформації про граничну модель та модель випадкових ефектів та про те, як вибрати між ними, я знайшов деяку інформацію, але це було більш-менш математичне абстрактне пояснення (як, наприклад, тут: https: //stats.stackexchange .com / a / 68753/38080 ). Десь я виявив, що між цими двома методами / моделями …

11 mixed-model  random-effects-model  glmm  gee  marginal-model 

У мене є випадкова логістична регресія перехоплення (за рахунок повторних вимірювань), і я хотів би провести деяку діагностику, зокрема стосовно людей, що перебувають у спокої та впливових спостережень. Я подивився на залишки, щоб побачити, чи існують спостереження. Але я також хотів би поглянути на щось на кшталт відстані Кука або …

11 mixed-model  outliers  glmm  cooks-distance 

Мені хотілося б використовувати lme4для зміщення регресії змішаних ефектів і multcompдля обчислення парних порівнянь. У мене складний набір даних з декількома безперервними і категоричними предикторами, але моє запитання можна продемонструвати, використовуючи вбудований ChickWeightнабір даних як приклад: m <- lmer(weight ~ Time * Diet + (1 | Chick), data=ChickWeight, REML=F) Timeє …

11 r  mixed-model  multiple-comparisons 

Зазвичай я маю справу з даними, де кілька осіб вимірюються кілька разів у кожному з двох або більше умов. Я нещодавно грав із моделюванням змішаних ефектів, щоб оцінити докази відмінностей між умовами, моделюючи individualяк випадковий ефект. Для візуалізації невизначеності щодо прогнозів такого моделювання я використовував завантажувальний запуск, де на кожній …

11 confidence-interval  mixed-model  bootstrap  monte-carlo  simulation 

Якщо ви вирішили проаналізувати конструкцію до контролю після лікування з безперервною залежною змінною за допомогою змішаної ANOVA, існують різні способи кількісного визначення ефекту перебування в групі лікування. Ефект взаємодії є одним з основних варіантів. Взагалі, мені особливо подобаються заходи типу Коена (тобто ). Мені не подобаються міри, пояснені дисперсією, оскільки …

11 anova  mixed-model  effect-size  cohens-d 

У мене є дані за два роки, які в основному виглядають так: Дата _ __ Насильство Y / N? _ Кількість пацієнтів 01.01.2008 _ ___ 0 __ _ __ _ ____ 11 1/1/2008 _ __ _ 0 _ __ _ __ _ __ 11 3/1/2008 _ ____ 1 __ _ …

11 r  mixed-model  autocorrelation  panel-data 

Моделі лінійних змішаних ефектів - це розширення моделей лінійної регресії для даних, які збираються та узагальнюються в групах. Ключові переваги - коефіцієнти можуть змінюватися залежно від однієї або декількох змінних групи. Однак я бореться з тим, коли використовувати модель зі змішаним ефектом? Свої запитання я опрацюю на прикладі іграшки в …

11 regression  mixed-model  random-effects-model  linear