Запитання з тегом «mixed-model»

Огляд питання Попередження: Це питання потребує багато налаштування. Будь ласка, нехай мене. Я та моя колега працюємо над розробкою експерименту. Дизайн повинен обходити велику кількість обмежень, які я перелічу нижче. Я розробив дизайн, який задовольняє обмеженням і дає нам неупереджені оцінки наших ефектів, що цікавлять. Однак мій колега вважає, що …

12 mixed-model  experiment-design  simulation  confounding 

Лінійні моделі змішаних ефектів часто не використовуються в моєму куточку біології, і мені потрібно подати статистичний тест, який я використовував у роботі, яку я намагаюся написати. Я знаю, що усвідомлення багаторівневого моделювання починає з'являтися в деяких областях біологічних наук ( Рішення залежності: використання багаторівневого аналізу для розміщення вкладених даних ), …

12 mixed-model  repeated-measures  reporting 

У мене дуже мало набору даних про величину одиночних бджіл, які у мене виникають проблеми з аналізом. Це дані підрахунку, і майже всі підрахунки знаходяться в одній обробці з більшістю нулів в іншій обробці. Також є пара дуже високих значень (по одному на два з шести ділянок), тому розподіл підрахунків …

12 count-data  negative-binomial  mixed-model  zero-inflation  lme4-nlme 

Я намагаюся обчислити ймовірність журналу для узагальненої нелінійної регресії найменших квадратів для функції оптимізована функціонують у пакеті R , використовуючи дисперсійну коваріаційну матрицю, породжену відстанями на філогенетичному дереві, припускаючи броунівський рух ( від пакета). Наступний відтворюваний код R підходить для моделі gnls з використанням даних x, y та випадкового дерева …

12 r  maximum-likelihood  least-squares  nonlinear-regression  mixed-model 

Я співвідносив дані і використовую модель змішаних ефектів логістичної регресії для оцінки індивідуального рівня (умовного) ефекту для прогнозованого інтересу. Я знаю, що для стандартних граничних моделей висновок про параметри моделі за допомогою тесту Вальда відповідає співвідношенню ймовірності та тестування балів. Зазвичай вони приблизно однакові. Оскільки Wald легко обчислити і доступний …

12 logistic  mixed-model  inference 

У мене було враження, що функція lmer()в lme4пакеті не виробляє р-значень (див. lmer, P-значення та все таке ). Я використовую MCMC згенерованих значень р замість як на це питання: Значний ефект в lme4змішаній моделі і на це питання: Чи не вдається знайти р-значення у виведенні з lmer()в lm4пакеті вR . …

12 r  mixed-model  p-value  mcmc  lme4-nlme 

Я підхоплюю модель випадкових ефектів glmerдо деяких бізнес-даних. Метою є аналіз результатів продажів через дистриб'ютора з урахуванням регіональних відмінностей. У мене є такі змінні: distcode: ідентифікатор дистриб'ютора, близько 800 рівнів region: географічний ідентифікатор верхнього рівня (північ, південь, схід, захід) zone: географія середнього рівня, що вкладається region, приблизно 30 рівнів territory: …

12 r  regression  mixed-model  lme4-nlme 

Мені знайомі такі позначення, як: yij=β0+βixij+uj+eij=β0j+βixij+eijyij=β0+βixij+uj+eij=β0j+βixij+eij\begin{align} y_{ij} &= \beta_0 + \beta_i x_{ij} + u_j + e_{ij}\\ &= \beta_{0j} + \beta_i x_{ij} + e_{ij} \end{align} where , іβ0j=β0+ujβ0j=β0+uj\beta_{0j}=\beta_{0}+u_j yij=β0+β1xij+u0j+u1jxij+eij=β0j+β1jxij+eijyij=β0+β1xij+u0j+u1jxij+eij=β0j+β1jxij+eij\begin{align} y_{ij} &= \beta_0 + \beta_1 x_{ij} + u_{0j} + u_{1j} x_{ij} + e_{ij} \\ &= \beta_{0j} + \beta_{1j} x_{ij} + e_{ij} \end{align} …

12 mixed-model  mathematical-statistics 

Я не зміг зрозуміти, як виконати лінійну регресію в R для повторного проекту вимірювання. У попередньому запитанні (все ще без відповіді) мені було запропоновано не використовувати, lmа скоріше використовувати змішані моделі. Я використовував lmнаступним чином: lm.velocity_vs_Velocity_response <- lm(Velocity_response~Velocity*Subject, data=mydata) (більш детальну інформацію про набір даних можна знайти за посиланням вище) …

12 r  regression  mixed-model  repeated-measures 

У мене виникають проблеми з ефективністю використання MCMCglmmпакету в R для запуску моделі зі змішаними ефектами. Код виглядає так: MC1<-MCMCglmm(bull~1,random=~school,data=dt,family="categorical" , prior=list(R=list(V=1,fix=1), G=list(G1=list(V=1, nu=0))) , slice=T, nitt=iter, ,burnin=burn, verbose=F) За даними є близько 20 000 спостережень, вони об'єднані приблизно в 200 шкіл. Перед запуском я видалив усі невикористані змінні з …

12 r  mixed-model  mcmc  computational-statistics 

Примітка: це запитання є репостом, оскільки моє попереднє питання довелося видалити з юридичних причин. Порівнюючи PROC MIXED від SAS з функцією lmeз nlmeпакету в R, я натрапив на деякі досить заплутані відмінності. Більш конкретно, ступеня свободи в різних випробувань відрізняються між PROC MIXEDі lme, і я задавався питанням, чому. Почніть …

12 r  mixed-model  sas  degrees-of-freedom  pdf  unbiased-estimator  distance-functions  functional-data-analysis  hellinger  time-series  outliers  c++  relative-risk  absolute-risk  rare-events  regression  t-test  multiple-regression  survival  teaching  multiple-regression  regression  self-study  t-distribution  machine-learning  recommender-system  self-study  binomial  standard-deviation  data-visualization  r  predictive-models  pearson-r  spearman-rho  r  regression  modeling  r  categorical-data  data-visualization  ggplot2  many-categories  machine-learning  cross-validation  weka  microarray  variance  sampling  monte-carlo  regression  cross-validation  model-selection  feature-selection  elastic-net  distance-functions  information-theory  r  regression  mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  dataset  data-mining 

Бібліотечна моваR забезпечує метод (pvals.fnc) для тестування значущості ефектів MCMC фіксованих ефектів в регресійній моделі змішаного ефекту, що підходить за допомогою lmer. Однак pvals.fnc видає помилку, коли модель lmer включає випадкові нахили. Чи є спосіб зробити тест гіпотези MCMC таких моделей? Якщо так, то як? (Щоб прийняти відповідь, має бути …

12 r  mixed-model  statistical-significance  monte-carlo 

У мене є набір даних, що складається з пропорцій, які вимірюють "рівень активності" окремих пуголовків, тому встановлюють значення, пов'язані між 0 і 1. Ці дані збираються шляхом підрахунку кількості разів, яку людина перемістив за певний проміжок часу (1 для руху, 0 без руху), а потім усереднюється для створення одного значення …

12 r  mixed-model  random-effects-model  beta-distribution  beta-regression 

Чи може хтось пояснити, будь ласка, різницю між змішаною моделлю та лінійним регресійним аналізом? (У мене статистичні дані дуже обмежені.)

12 regression  mixed-model 

Я намагаюся проаналізувати дані повторних заходів і борюся за те, щоб це працювало R. Мої дані по суті такі, у мене дві групи лікування. Кожен предмет у кожній групі тестується щодня та отримує бал (відсоток правильний у тесті). Дані у довгому форматі: Time Percent Subject Group 1 0 GK11 Ethanol …

12 r  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme