Запитання з тегом «mixed-model»

Я розглядав моделювання змішаних ефектів за допомогою пакету lme4 в Р. Я в основному використовую lmerкоманду, тому я буду ставити своє запитання через код, який використовує цей синтаксис. Я думаю, що може бути загальним простим питанням: чи добре порівнювати будь-які дві моделі, побудовані з lmerвикористанням коефіцієнтів ймовірності на основі однакових …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Логіка багаторазової імпутації (ІМ) полягає в тому, щоб присвоїти пропущені значення не один раз, а декілька (як правило, М = 5) разів, в результаті чого було завершено набір даних M. Потім завершені набори даних аналізуються методами повних даних, за допомогою яких оцінювання М та їх стандартні помилки поєднуються за допомогою …

20 modeling  confidence-interval  mixed-model  data-imputation 

Точність визначається як: p = true positives / (true positives + false positives) Чи правильно, що як true positivesі false positivesпідхід 0, точність наближається до 1? Те саме запитання для відкликання: r = true positives / (true positives + false negatives) Зараз я впроваджую статистичний тест, де мені потрібно обчислити …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Ми знаємо, що парний t- test - це лише особливий випадок односторонньої (або всередині суб'єкта) ANOVA, а також лінійної моделі зі змішаним ефектом, яку можна продемонструвати за допомогою lme () функції пакету nlme в R як показано нижче. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) # Now …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Розглянемо наступні дані з двостороннього проектування предметів: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu 9 6 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Скажімо, ми маємо GLMM mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Ці моделі не вкладені у звичайному розумінні: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- glmer(y …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Скажімо, ми працюємо над моделлю випадкових ефектів деяких даних підрахунку з часом, і ми хочемо контролювати деякі тенденції. Зазвичай ви робите щось на кшталт: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") включити квадратичну форму для t. Чи можна використовувати деякі більш складні методи згладжування, такі як ЗЛАСНЕ згладжування або сплайси для …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Існує відмінність, яка мене спонукає до змішаних моделей, і мені цікаво, чи зможу я отримати трохи ясності. Припустимо, у вас є змішана модель підрахунку даних. Є змінна, яку ви знаєте, що ви хочете як фіксований ефект (A), і інша змінна для часу (T), згрупована за словами змінної "Site". Як я …

19 r  mixed-model  lme4-nlme 

В основному, мені цікаво, як застосовуються різні структури коваріації та як обчислюються значення всередині цих матриць. Такі функції, як lme (), дозволяють нам вибрати, яку структуру ми б хотіли, але я хотів би знати, як вони оцінюються. Розглянемо модель лінійних змішаних ефектів .Y=Xβ+Zu+ϵY=Xβ+Zu+ϵY=X\beta+Zu+\epsilon Де і . Крім того:ϵ d ∼ …

19 mixed-model  random-effects-model  covariance  covariance-matrix 

Я намагаюся використовувати lmeз nlmeпакету для копіювання результатів aovдля повторних заходів ANOVA. Я зробив це для експерименту з однофакторними повторними заходами та для двофакторного експерименту з одним фактором між суб'єктами та одним фактором всередині суб'єктів, але у мене виникають проблеми з експериментом з двома факторами з двома в межах -предметні …

19 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Я намагаюся створити модель, для якої у мене є змінна відповідь, яка є пропорцією між 0 і 1, сюди входить досить багато 0 і 1, але також багато значень між ними. Я думаю про спробу бета-регресії. Пакет, який я знайшов для R (betareg), допускає значення лише між 0 і 1, …

19 regression  mixed-model  beta-distribution  zero-inflation  beta-regression 

Будь ласка, врахуйте ці дані: dt.m <- structure(list(id = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12), occasion = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, …

19 r  mixed-model  stata  lme4-nlme 

У відповідь на це питання, щодо того, чи мій дизайн, де я випадковим чином представляв учасникам картинки з різних категорій, був прикладом, коли я повинен використовувати повторні заходи ANOVA, я отримав відповідь, що замість цього я повинен використовувати змішану модель тому що я маю дві форми залежності: для предметів та …

19 anova  mixed-model  repeated-measures 

Чи можу я отримати допомогу у виконанні цієї попередньої (триває) спроби отримати підшипники на еквівалентах ANOVA та REGRESSION? Я намагаюся узгодити поняття, номенклатуру та синтаксис цих двох методологій. Є багато повідомлень на цьому сайті , про їх спільності, наприклад , цього або цього , але це все-таки добре мати швидкий …

18 regression  anova  mixed-model 

Я проглянув кілька книг (Рауденбуш і Брик, Сніджерс і Боскер, Гельман і Хілл та ін.) Та кілька статей (Гельман, Юсько, Примо та Якобсмієр тощо), і я все ще не дуже обертав голову основні відмінності між використанням кластеризованих стандартних помилок віршів багаторівневого моделювання. Я розумію частини, які стосуються дослідницького питання; є …

18 mixed-model  multilevel-analysis  clustered-standard-errors