Запитання з тегом «survival»

Чи може хтось пояснити мені свою модель Кокса простою англійською мовою? Наступну модель регресії Кокса я прилаштував до всіх своїх даних за допомогою cphфункції. Мої дані зберігаються в об'єкті, який називається Data. Змінні w, xі yє безперервними; zє фактором двох рівнів. Час вимірюється місяцями. Деяким з моїх пацієнтів відсутні дані …

14 r  cross-validation  survival  cox-model 

Я намагався розрізнити, що саме означають "coef" та "(exp) coef" coxph. Здається, що "(exp) coef" - це порівняння першої змінної в моделі відповідно до групи, призначеної в команді. Як функція coxph доходить до значень "coef" та "(exp) coef"? Окрім того, як coxph визначає ці значення, коли проводиться цензура?

14 r  survival  interpretation 

Я знаю, що традиційні статистичні моделі, такі як регресія пропорційних ризиків Кокса та деякі моделі Каплана-Мейєра, можуть використовуватися для прогнозування днів до наступного виникнення події, наприклад, відмови тощо, тобто аналізу виживання Запитання Як можна використовувати регресійну версію моделей машинного навчання, таких як GBM, нейронні мережі тощо, для прогнозування днів до …

13 machine-learning  classification  survival  cox-model  kaplan-meier 

Я читав про те, що таке цензура, і як це потрібно враховувати в аналізі виживання, але хотів би почути менш математичне визначення цього і більш інтуїтивне визначення (фотографії були б чудовими!). Чи може хто-небудь надати мені пояснення: 1) цензура та 2) як це впливає на такі речі, як криві Каплана-Меєра …

13 survival  cox-model  censoring 

У регресійному моделюванні стратегій Гаррелла (друге видання) є розділ (S. 20.1.7), де обговорюються моделі Кокса, включаючи взаємодію між коваріатом, основний вплив якого на виживання ми хочемо оцінити також (вік у прикладі нижче) та коваріат, основний ефект якого ми не хочемо оцінювати (стать у наведеному нижче прикладі). Конкретно: припустимо, що в …

13 survival  cox-model  stratification 

Я розумію, що коефіцієнт небезпеки з моделі пропорційної небезпеки Кокса порівнює вплив на ступінь небезпеки для даного фактору з еталонною групою. Як би ви повідомили про це аудиторії, яка не знає статистики? Спробуємо сформулювати приклад. Скажіть, ми зараховуємо людей до дослідження, скільки часу перед тим, як придбати диван. Ми правоцензуруємо …

13 survival  cox-model 

Я налаштовував модель за допомогою caret, але потім повторно запустив модель за допомогою gbmпакета. Наскільки я розумію, що caretпакет використовує gbmі вихід повинен бути однаковим. Однак, лише швидкий тестовий пробіг із застосуванням data(iris)показує невідповідність моделі приблизно 5%, використовуючи RMSE і R ^ 2 в якості метрики оцінювання. Я хочу знайти …

13 r  caret  gbm  matrix  linear-algebra  logistic  modeling  logit  ordered-logit  r  confidence-interval  survival  population  weibull  classification  separation  hypothesis-testing  correlation  statistical-significance  p-value  python  r  data-visualization  r  regression  multiple-regression  chi-squared  multivariate-analysis  distributions  random-variable  experiment-design  distributions  poisson-regression  residuals  excel  time-series  garch  var  survival  modeling  cox-model  interaction  r  pca  normality-assumption 

У цьому конкретному випадку я маю на увазі день, коли озеро замерзає. Ця "крижана" дата трапляється лише раз на рік, але іноді вона взагалі не відбувається (якщо зима тепла). Так що одного року озеро може замерзнути 20-го дня (20 січня), а іншого року воно може взагалі не замерзнути. Мета - …

13 regression  time-series  survival  data-transformation  recurrent-events 

Я працюю над класичною проблемою прогнозування холону, використовуючи кількість відвідувань певного користувача на сайт, і я вважав, що Пуассонова регресія - це правильний інструмент для моделювання майбутнього залучення цього користувача. Тоді я натрапив на книгу про аналіз виживання та моделювання небезпеки, і я не знаю, яка методика найкраща. Я не …

13 survival  hazard  poisson-process 

Я хочу обчислити передбачувану функцію виживання для моделі пропорційної небезпеки Кокса з термінами крихкості [використовуючи пакет виживання]. Виявляється, що, коли в моделі є терміни слабкості, прогнозовану функцію виживця неможливо обчислити. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake weight set.seed(90989) rats$weight<-runif(nrow(rats),0.2,0.9) ## Cox model with gamma frailty on litter fit <- …

13 r  survival  cox-model  frailty 

Я хочу порівняти два різні методи виявлення зміни статусу в аналізі виживання. Група досліджуваних спостерігається протягом більш тривалого періоду (багато років), і два методи обстеження використовуються для перевірки того, чи відбулася зміна статусу; один метод був використаний для обстеження кожного суб'єкта двічі на рік, а другий - для обстеження кожного …

13 survival  paired-data 

Мені потрібно оцінити базову функцію небезпеки у залежності від часу моделі Коксаλ0( t )λ0(т)\lambda_0(t) λ ( t ) = λ0( t ) експ( Z( t )'β)λ(т)=λ0(т)досвід⁡(Z(т)'β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Поки я проходив курс виживання, я пам’ятаю, що пряма похідна від функції накопичувальної небезпеки ( ) не була б хорошим оцінником, …

13 r  survival  cox-model 

Вибачте заздалегідь, якщо будь-яка термінологія, яку я використовую, є невірною. Я вітаю будь-які виправлення. Якщо те, що я характеризую як "відсікання", має інше ім'я, дайте мені знати, і я можу оновити питання. Мене цікавить ситуація така: у вас є незалежні змінні і одна залежна змінна . Я залишу це розпливчастим, …

12 regression  modeling  survival  censoring 

Примітка: це запитання є репостом, оскільки моє попереднє питання довелося видалити з юридичних причин. Порівнюючи PROC MIXED від SAS з функцією lmeз nlmeпакету в R, я натрапив на деякі досить заплутані відмінності. Більш конкретно, ступеня свободи в різних випробувань відрізняються між PROC MIXEDі lme, і я задавався питанням, чому. Почніть …

12 r  mixed-model  sas  degrees-of-freedom  pdf  unbiased-estimator  distance-functions  functional-data-analysis  hellinger  time-series  outliers  c++  relative-risk  absolute-risk  rare-events  regression  t-test  multiple-regression  survival  teaching  multiple-regression  regression  self-study  t-distribution  machine-learning  recommender-system  self-study  binomial  standard-deviation  data-visualization  r  predictive-models  pearson-r  spearman-rho  r  regression  modeling  r  categorical-data  data-visualization  ggplot2  many-categories  machine-learning  cross-validation  weka  microarray  variance  sampling  monte-carlo  regression  cross-validation  model-selection  feature-selection  elastic-net  distance-functions  information-theory  r  regression  mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  dataset  data-mining 

Я вивчаю середню виживаність, використовуючи Каплан-Мейєра в різних станах для типу раку. Існують досить великі відмінності між державами. Як я можу порівняти середню виживаність між усіма державами та визначити, які з них суттєво відрізняються від середньої середньої виживаності по всій країні?

12 multiple-comparisons  survival