Запитання з тегом «negative-binomial»

Після проведення аналізу основних компонентів (PCA) я хочу спроектувати новий вектор на простір PCA (тобто знайти його координати в системі координат PCA). Я розрахував PCA мовою R за допомогою prcomp. Тепер я повинен мати можливість помножити свій вектор на матрицю обертання PCA. Чи повинні головні компоненти в цій матриці розташовуватися …

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

Точність визначається як: p = true positives / (true positives + false positives) Чи правильно, що як true positivesі false positivesпідхід 0, точність наближається до 1? Те саме запитання для відкликання: r = true positives / (true positives + false negatives) Зараз я впроваджую статистичний тест, де мені потрібно обчислити …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Хтось із вас, можливо, прочитав цей приємний документ: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Не записуйте дані про кількість перетворень. Методи екології та еволюції 1: 118–122. клацати . У моїй галузі досліджень (екотоксикологія) ми маємо справу з погано повторюваними експериментами, і ГЛМ не використовуються широко. Тому я зробив аналогічне моделювання, як …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Skellam Розподіл описує різницю між двома змінними , які мають розподіл Пуассона. Чи існує подібний розподіл, який описує різницю між змінними, які слідують за негативними біноміальними розподілами? Мої дані виробляються методом Пуассона, але містять неабияку кількість шуму, що призводить до надмірної дисперсії в розповсюдженні. Таким чином, моделювання даних з негативним …

18 distributions  modeling  poisson-distribution  negative-binomial  skellam 

Ми з вами вирішили пограти в гру, де ми по черзі гортаємо монету. Перший гравець, який перевернув 10 головок, виграє гру. Природно, є аргумент про те, хто повинен йти першим. Симулятори цієї гри показують, що гравець, який перевертає спочатку, виграє на 6% більше, ніж той, хто перевертає другий (перший гравець …

17 probability  python  binomial  negative-binomial 

Питання Дисперсія негативного біноміального розподілу (NB) завжди більша за середню. Коли середнє значення вибірки більше, ніж його дисперсія, спроба пристосувати параметри НБ з максимальною вірогідністю або з моментом оцінки не вдасться (рішення з кінцевими параметрами не існує). Однак можливо, що вибірка, взята з розподілу НБ, має значення більше, ніж дисперсія. …

17 estimation  maximum-likelihood  negative-binomial 

У мене є наступна гістограма даних про підрахунок. І я хотів би пристосувати до нього дискретний розподіл. Я не впевнений, як мені це робити. Чи слід спочатку накласти на гістограму дискретний розподіл, скажімо, негативний біноміальний розподіл, щоб я отримав параметри дискретного розподілу, а потім запустив тест Колмогорова – Смірнова для …

17 r  poisson-distribution  discrete-data  computational-statistics  negative-binomial 

Чи існує такий пакет, який передбачає оцінку моделі нульових надутих негативних біноміальних змішаних ефектів у R? Під цим я маю на увазі: Нульова інфляція, де можна вказати біноміальну модель нульової інфляції, як у функції zeroinfl в пакеті pscl: zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "негбін") де Z - …

17 r  mixed-model  count-data  negative-binomial  zero-inflation 

Негативний біноміальний розподіл став популярною моделлю для підрахунку даних (зокрема, очікуваної кількості зчитування послідовностей у певній області геному від заданого експерименту) у біоінформатиці. Пояснення варіюються: Деякі пояснюють це як щось, що працює як розподіл Пуассона, але має додатковий параметр, що дозволяє більше свободи моделювати справжній розподіл, причому дисперсія не обов'язково …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Розподіл Пуассона може вимірювати події за одиницю часу, а параметр - . Експонентний розподіл вимірює час до наступної події параметром . Можна перетворити один розподіл в інший, залежно від того, чи легше моделювати події чи час.1λλ\lambda1λ1λ\frac{1}{\lambda} Тепер гамма-пуассон - це "розтягнутий" пуассон з більшою дисперсією. Розподіл Вейбула - це "розтягнута" …

16 poisson-distribution  negative-binomial  gamma-distribution  exponential-family 

Яка відповідна стратегія для вирішення, яку модель використовувати для даних лічильників? У мене є кількість даних, які мені потрібні для моделювання як багаторівневої моделі, і мені було рекомендовано (на цьому веб-сайті), що найкращий спосіб зробити це через помилки або MCMCglmm. Однак я все ще намагаюся дізнатися про байєсівську статистику, і …

16 poisson-distribution  generalized-linear-model  negative-binomial  overdispersion 

Я часто бачив поради щодо перевірки того, чи підходить модель Пуассона надмірно розсіяною, що включає ділення залишкового відхилення на ступінь свободи. Отримане співвідношення має бути «приблизно 1». Питання полягає в тому, про який діапазон ми говоримо для "приблизного" - що таке співвідношення, яке повинно запускати тривогу для розгляду альтернативних форм …

16 poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion 

Яка очікувана кількість разів, коли потрібно скочувати штамп, поки кожна сторона не з’явиться 3 рази? Це питання задавали в початковій школі Нової Зеландії, і це було вирішено за допомогою моделювання. Яке аналітичне рішення цієї проблеми?

15 probability  multinomial  negative-binomial  coupon-collector-problem 

Отже, я хочу підходити до випадкової ефекти негативно-біноміальної моделі. Для такої моделі STATA може виробляти коефіцієнти експоненції. Відповідно до файлу довідки такі коефіцієнти можна інтерпретувати як коефіцієнти захворюваності. На жаль, я не є носієм англійської мови, і я не дуже розумію, що таке коефіцієнт частоти захворюваності або як я міг …

14 interpretation  negative-binomial  regression-coefficients 

Я щойно запустив негативний біноміальний GLM, і це вихід: Call: glm.nb(formula = small ~ method + site + depth, data = size.dat, init.theta = 1.080668549, link = log) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.2452 -0.9973 -0.3028 0.3864 1.8727 Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 1.6954 0.1152 …

14 r  categorical-data  generalized-linear-model  interpretation  negative-binomial