Запитання з тегом «permutation-test»

Я намагаюся зрозуміти різницю між різними методами перестановки (моделювання в Монте-Карло, параметричне завантаження, непараметричне завантаження, джеккніфінг, крос-валідація, тести рандомізації та тести перестановки) та їх реалізацію в моєму власному контексті за допомогою Р. Скажімо, у мене є така ситуація - я хочу виконати ANOVA зі змінною Y ( Yvar) та X …

73 r  bootstrap  resampling  jackknife  permutation-test 

У мене є кілька сотень вимірювань. Тепер я розглядаю можливість використання певного програмного забезпечення для співвіднесення кожного з кожним заходом. Це означає, що є тисячі кореляцій. Серед них має бути (статистично) висока кореляція, навіть якщо дані є абсолютно випадковими (кожен захід має лише близько 100 точок даних). Коли я знаходжу …

66 correlation  multiple-comparisons  permutation-test 

У мене є дані експерименту, які я аналізував, використовуючи t-тести. Залежна змінна масштабується за інтервалом, і дані є непарними (тобто, 2 групи) або парними (тобто, в межах суб'єктів). Напр. (В межах предметів): x1 <- c(99, 99.5, 65, 100, 99, 99.5, 99, 99.5, 99.5, 57, 100, 99.5, 99.5, 99, 99, 99.5, …

56 r  t-test  nonparametric  permutation-test 

Існує кілька популярних методів перестановки, які часто використовуються на практиці, такі як завантажувальний запуск, перестановка на перестановку, джекніф і т. Д. Існують численні статті та книги, які обговорюють ці методи, наприклад , тести перестановки, параметричні та завантажувальні функції «Філіпп I хороший» (2010). Гіпотези Моє запитання, яка техніка перекомпонування отримала більшу …

37 hypothesis-testing  nonparametric  bootstrap  permutation-test 

Я використовую пакет "boot" для обчислення приблизного двостороннього завантаженого p-значення, але результат занадто далекий від p-значення використання t.test. Я не можу зрозуміти, що я зробив не так у своєму R-коді. Може хтось, будь ласка, підкаже мені про це time = c(14,18,11,13,18,17,21,9,16,17,14,15, 12,12,14,13,6,18,14,16,10,7,15,10) group=c(rep(1:2, each=12)) sleep = data.frame(time, group) require(boot) diff …

28 r  hypothesis-testing  p-value  bootstrap  permutation-test 

Читаючи резюме класики постійного часу, я натрапив на твердження, яке хотів би уточнити. Це повідомлення, і моє запитання стосується заключного зауваження: "Я маю зазначити, що всі знання, які я тільки що передав, дещо застаріли; тепер, коли у нас є комп’ютери, ми можемо робити краще, ніж t-тести. Як зазначає Франк, ви …

25 hypothesis-testing  t-test  permutation-test  wilcoxon-mann-whitney 

Часто зазначається, що тести на перестановку не мають припущень, однак це, безумовно, не вірно. Наприклад, якщо мої зразки якимось чином співвіднесені, я можу уявити, що перекручування їх міток було б не правильним. Думаю, що про цю проблему я знайшов, - це речення з вікіпедії: "Важливе припущення, що стоїть за тестом …

22 hypothesis-testing  permutation-test  resampling 

Припустимо, у мене є дані з двома незалежними групами: g1.lengths <- c (112.64, 97.10, 84.18, 106.96, 98.42, 101.66) g2.lengths <- c (84.44, 82.10, 83.26, 81.02, 81.86, 86.80, 85.84, 97.08, 79.64, 83.32, 91.04, 85.92, 73.52, 85.58, 97.70, 89.72, 88.92, 103.72, 105.02, 99.48, 89.50, 81.74) group = rep (c ("g1", "g2"), c …

18 r  hypothesis-testing  bootstrap  small-sample  permutation-test 

У мене є набір даних з десятками тисяч спостережень за даними медичних витрат. Ці дані сильно перекошені праворуч і мають багато нулів. Це виглядає так для двох груп людей (у цьому випадку два вікові групи з> 3000 одиниць у кожній): Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. 0.0 0.0 …

18 t-test  skewness  permutation-test 

У мене є два набори даних, і я хотів би знати, чи вони значно відрізняються чи ні (це походить від " Дві групи значно відрізняються? Тест для використання "). Я вирішив використати тест на перестановку, зробивши наступне в R: permutation.test <- function(coding, lncrna) { coding <- coding[,1] # dataset1 lncrna …

15 p-value  permutation-test 

Перестановочні тести (також називаються тестом рандомизації, тестом на повторну рандомізацію або точним тестом) дуже корисні і корисні, коли припущення про нормальний розподіл, необхідне, наприклад, t-testне виконується, і при перетворенні значень за ранжуванням непараметричний тест, як-от Mann-Whitney-U-test, призведе до втрати більше інформації. Однак одне і єдине припущення не слід оминути увагою …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

У літературі терміни Рандомізація та Перестановка вживаються взаємозамінно. Багато авторів заявляють про "перестановку (також рандомізацію) тестів", або навпаки. У кращому випадку я вважаю, що різниця є тонкою, і вона полягає в їх припущеннях щодо даних та потенційних висновків, які можна зробити. Мені просто потрібно перевірити, чи моє розуміння правильне, чи …

15 hypothesis-testing  sampling  terminology  permutation-test 

Нещодавно я шукав способи повторного втілення часових рядів у такий спосіб Приблизно зберігають автоматичну кореляцію довгих процесів пам'яті. Збережіть область спостережень (наприклад, повторно впорядкований часовий ряд цілих чисел - це ще й цілий ряд цілих чисел). Може впливати лише на деякі ваги, якщо потрібно. Я придумав таку схему перестановки для …

14 time-series  bootstrap  resampling  permutation-test 

Я зараз вивчаю тести рандомізації. Мені на думку спадають два питання: Так, легко та інтуїтивно зрозуміло, як р-значення обчислюється тестом рандомізації (на мою думку, це те саме, що і тест на перестановку?). Однак як ми могли також генерувати довірчий інтервал 95%, як це робимо при звичайних параметричних тестах? Коли я …

12 confidence-interval  p-value  permutation-test 

У мене є дві категоріальні / номінальні змінні. Кожен з них може приймати лише два різних значення (так, у мене всього 4 комбінації). Кожна комбінація значень поставляється з набором числових значень. Отже, у мене є 4 набори цифр. Щоб зробити це більш конкретним, скажімо, що я маю male / femaleі …

10 hypothesis-testing  p-value  nonparametric  permutation-test