Запитання з тегом «anova»

Нещодавно я зрозумів, що змішана модель із лише предметом як випадковим фактором та іншими чинниками як фіксованими факторами еквівалентна ANOVA при встановленні кореляційної структури змішаної моделі на симетричну сполуку. Тому я хотів би знати, що означає складна симетрія в контексті змішаної (тобто розділеної ділянки) ANOVA, в кращому випадку пояснюваної простою …

35 correlation  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Дорогі всі - я помітив щось дивне, чого я не можу пояснити, чи не так? Підсумовуючи: ручний підхід до обчислення довірчого інтервалу в моделі логістичної регресії та функції R confint()дають різні результати. Я пережив прикладну логістичну регресію Hosmer & Lemeshow (2-е видання). У 3-й главі є приклад обчислення коефіцієнта шансів …

34 r  regression  logistic  confidence-interval  profile-likelihood  correlation  mcmc  error  mixture  measurement  data-augmentation  r  logistic  goodness-of-fit  r  time-series  exponential  descriptive-statistics  average  expected-value  data-visualization  anova  teaching  hypothesis-testing  multivariate-analysis  r  r  mixed-model  clustering  categorical-data  unsupervised-learning  r  logistic  anova  binomial  estimation  variance  expected-value  r  r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures  project-management  r  poisson-distribution  control-chart  project-management  regression  residuals  r  distributions  data-visualization  r  unbiased-estimator  kurtosis  expected-value  regression  spss  meta-analysis  r  censoring  regression  classification  data-mining  mixture 

З документації для anova(): Коли дається послідовність об'єктів, 'anova' перевіряє моделі один проти одного у визначеному порядку ... Що означає тестування моделей одна проти одної? І чому порядок має значення? Ось приклад з підручника GenABEL : > modelAdd = lm(qt~as.numeric(snp1)) > modelDom = lm(qt~I(as.numeric(snp1)>=2)) > modelRec = lm(qt~I(as.numeric(snp1)>=3)) anova(modelAdd, modelGen, …

32 r  anova 

Я аналізую експериментальний набір даних. Дані складаються з парного вектора типу лікування та біноміального результату: Treatment Outcome A 1 B 0 C 0 D 1 A 0 ... У стовпці результатів 1 позначає успіх, а 0 позначає невдачу. Я хотів би з’ясувати, чи суттєво варіює лікування результат. Існує 4 різних …

32 logistic  anova  binomial  experiment-design 

Скажімо, наприклад, ви робите лінійну модель, але дані є складними.yуy y=xβ+ϵу=хβ+ϵ y = x \beta + \epsilon Мій набір даних є складним, оскільки всі числа у мають вигляд . Чи є щось процедурно інше при роботі з такими даними?( a + b i )yуy(a+bi)(а+бi)(a + bi) Я прошу, бо ви …

31 regression  anova  data-transformation  complex-numbers 

Я намагаюся проаналізувати деякі дані, використовуючи модель змішаного ефекту. Дані, які я зібрав, представляють вагу деяких молодих тварин різного генотипу в часі. Я використовую запропонований тут підхід: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ Зокрема, я використовую рішення №2 Тож у мене щось подібне require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, random = ~1|Animal/time, data=weights) …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Сподіваюсь, це питання, на який хтось тут може відповісти за мене про характер розкладання сум квадратів у моделі змішаних ефектів, що відповідає lmer(з пакету lme4 R). По-перше, я повинен сказати, що мені відомо про суперечки з використанням цього підходу, і на практиці я з більшою ймовірністю використовую завантажений LRT для …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Чи можливо односторонній (з групами або "рівнями") ANOVA повідомити про істотну різницю, коли жоден з парних t-тестів не робить?N> 2N>2N>2N( N- 1 ) / 2N(N-1)/2N(N-1)/2 У цій відповіді @whuber написав: Добре відомо, що глобальний тест ANOVA F може виявити різницю засобів навіть у тих випадках, коли жоден індивідуальний [невідрегульований парний] …

29 statistical-significance  anova  t-test  post-hoc 

Зачинено. Це питання поза темою . Наразі відповіді не приймаються. Хочете вдосконалити це питання? Оновіть питання, щоб воно було тематичним для перехресної перевірки. Закрито 2 роки тому . Я використовую caret, щоб запустити перехрещений випадковий ліс над набором даних. Змінна Y - фактор. У моєму наборі даних немає NaN, Inf …

29 r  random-forest  caret  regression  prediction  fitting  social-science  poisson-distribution  distributions  characteristic-function  bayesian  prior  regression  normal-distribution  interaction  nonparametric  skewness  svm  standard-deviation  standard-error  regression-coefficients  igraph  natural-language  word2vec  word-embeddings  regression  machine-learning  sampling  r  regression  machine-learning  random-forest  ensemble  sampling  unbiased-estimator  proof  estimators  mse  probability  conditional-probability  bayes  anova  missing-data  neural-networks  recommender-system  r  confidence-interval  sample  multiple-imputation  r  time-series  forecasting  mase 

Я хотів би отримати p-значення та розмір ефекту незалежної категоріальної змінної (з декількома рівнями) - тобто "загальний", а не для кожного рівня окремо, як це нормальний вихід lme4у R. Це просто так про що люди повідомляють під час роботи програми ANOVA. Як я можу це отримати?

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Я щойно натрапив на цю статтю , в якій описано, як обчислити повторюваність (він же - надійність, також внутрішньокласова кореляція) вимірювання за допомогою моделювання змішаних ефектів. R-код буде: #fit the model fit = lmer(dv~(1|unit),data=my_data) #obtain the variance estimates vc = VarCorr(fit) residual_var = attr(vc,'sc')^2 intercept_var = attr(vc$id,'stddev')[1]^2 #compute the unadjusted …

28 mixed-model  reliability  intraclass-correlation  repeatability  spss  factor-analysis  survey  modeling  cross-validation  error  curve-fitting  mediation  correlation  clustering  sampling  machine-learning  probability  classification  metric  r  project-management  optimization  svm  python  dataset  quality-control  checking  clustering  distributions  anova  factor-analysis  exponential  poisson-distribution  generalized-linear-model  deviance  machine-learning  k-nearest-neighbour  r  hypothesis-testing  t-test  r  variance  levenes-test  bayesian  software  bayesian-network  regression  repeated-measures  least-squares  change-scores  variance  chi-squared  variance  nonlinear-regression  regression-coefficients  multiple-comparisons  p-value  r  statistical-significance  excel  sampling  sample  r  distributions  interpretation  goodness-of-fit  normality-assumption  probability  self-study  distributions  references  theory  time-series  clustering  econometrics  binomial  hypothesis-testing  variance  t-test  paired-comparisons  statistical-significance  ab-test  r  references  hypothesis-testing  t-test  normality-assumption  wilcoxon-mann-whitney  central-limit-theorem  t-test  data-visualization  interactive-visualization  goodness-of-fit 

Яка різниця між повторними заходами ANOVA над деяким фактором (скажімо, експериментальним станом) та MANOVA? Зокрема, один веб-сайт, на який я натрапив, припустив, що MANOVA не робить те саме припущення про сферичність, яке робить повторні заходи ANOVA, це правда? Якщо так, то чому б не просто завжди використовувати MANOVA? Я намагаюся …

26 anova  repeated-measures  manova  sphericity 

Надайте код R, який дозволяє проводити ANOVA між суб'єктами з -3, -1, 1, 3 контрастами. Наскільки я розумію, існує дискусія щодо відповідного типу суми квадратів (СС) для такого аналізу. Однак як стандартний тип SS, що використовується в SAS та SPSS (тип III), вважається стандартом у моїй області. Тому я хотів …

26 r  anova  contrasts  sums-of-squares 

У lmerTestпакеті передбачена anova()функція для лінійних змішаних моделей з необов'язковою програмою Satterthwaite (за замовчуванням) або наближенням Кенвард-Роджера до ступенів свободи (df). Яка різниця між цими двома підходами? Коли вибрати який?

25 r  anova  mixed-model  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

ANOVA проти множинної лінійної регресії? Я розумію, що обидва ці методи, здається, використовують однакову статистичну модель. Однак за яких обставин слід використовувати який метод? Які переваги та недоліки цих методів у порівнянні? Чому ANOVA так часто використовується в експериментальних дослідженнях, і я навряд чи знайду регресійне дослідження?

24 anova  multiple-regression  least-squares