Запитання з тегом «contingency-tables»

У mgcvпакеті Rє дві функції для встановлення тензорних взаємодій між продуктами: te()і ti(). Я розумію основний розподіл праці між двома (встановлення нелінійної взаємодії проти декомпозиції цієї взаємодії на основні ефекти та взаємодію). Чого я не розумію, це чому te(x1, x2)і ti(x1) + ti(x2) + ti(x1, x2)може давати (трохи) різні результати. …

11 r  gam  mgcv  conditional-probability  mixed-model  references  bayesian  estimation  conditional-probability  machine-learning  optimization  gradient-descent  r  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  time-series  bayesian  inference  change-point  time-series  anova  repeated-measures  statistical-significance  bayesian  contingency-tables  regression  prediction  quantiles  classification  auc  k-means  scikit-learn  regression  spatial  circular-statistics  t-test  effect-size  cohens-d  r  cross-validation  feature-selection  caret  machine-learning  modeling  python  optimization  frequentist  correlation  sample-size  normalization  group-differences  heteroscedasticity  independence  generalized-least-squares  lme4-nlme  references  mcmc  metropolis-hastings  optimization  r  logistic  feature-selection  separation  clustering  k-means  normal-distribution  gaussian-mixture  kullback-leibler  java  spark-mllib  data-visualization  categorical-data  barplot  hypothesis-testing  statistical-significance  chi-squared  type-i-and-ii-errors  pca  scikit-learn  conditional-expectation  statistical-significance  meta-analysis  intuition  r  time-series  multivariate-analysis  garch  machine-learning  classification  data-mining  missing-data  cart  regression  cross-validation  matrix-decomposition  categorical-data  repeated-measures  chi-squared  assumptions  contingency-tables  prediction  binary-data  trend  test-for-trend  matrix-inverse  anova  categorical-data  regression-coefficients  standard-error  r  distributions  exponential  interarrival-time  copula  log-likelihood  time-series  forecasting  prediction-interval  mean  standard-error  meta-analysis  meta-regression  network-meta-analysis  systematic-review  normal-distribution  multiple-regression  generalized-linear-model  poisson-distribution  poisson-regression  r  sas  cohens-kappa 

У своїй роботі я бачив кілька застосувань точного тесту Фішера, і мені було цікаво, наскільки він добре відповідає моїм даним. Дивлячись на кілька джерел, я розумів, як обчислити статистику, але ніколи не бачив чіткого та формального пояснення припущеної нульової гіпотези. Чи може мені хтось пояснити чи направити мені офіційне пояснення …

11 hypothesis-testing  chi-squared  multinomial  contingency-tables  fishers-exact 

Я аналізую таблицю 2x2 з невеликого набору даних з 30 пацієнтів. Ми ретроспективно намагаємось знайти деякі змінні, які дають підказку щодо того, яке лікування вибрати. Змінні (нормальні / дивні) та рішення щодо лікування (A / B) представляють особливий інтерес, тому дані виглядають так: Obs / Tr. Груд.нормальнийдивноА12012Б1351825530Obs/Tr. Dec.ABnormal121325strange055121830\begin{array} {|r|r|r|r|} \hline …

11 chi-squared  power  contingency-tables  fishers-exact 

Припустимо, у нас є такий набір даних: Men Women Dieting 10 30 Non-dieting 5 60 Якщо я проведу точний тест Фішера в R, то що означає alternative = greater(або менше)? Наприклад: mat = matrix(c(10,5,30,60), 2,2) fisher.test(mat, alternative="greater") Я отримую p-value = 0.01588і odds ratio = 3.943534. Крім того, коли я …

11 r  statistical-significance  contingency-tables  fishers-exact 

Далі йде питання про безліч візуалізацій, пропонованих як «доказ за картиною» існування парадоксу Сімпсона, і, можливо, питання про термінологію. Парадокс Сімпсона - досить просте явище для опису та надання чисельних прикладів (причина, чому це може статися, є глибокою та цікавою). Парадокс полягає в тому, що існують таблиці на випадок 2–2x2 …

10 mathematical-statistics  data-visualization  causality  contingency-tables  simpsons-paradox 

Я намагаюся зрозуміти використання логістичної регресії в таблицях на випадок 2–2 та Ix2. Наприклад, використовуючи це як приклад Яка різниця між використанням тесту чи-квадрата та використанням логістичної регресії? Як щодо таблиці з декількома номінальними коефіцієнтами (таблиця Ix2) на зразок цієї: Існує аналогічне питання тут - але відповідь в основному , …

10 logistic  chi-squared  logit  contingency-tables 

Я тестую незалежність в таблицю спряженості. Я не знаю, чи краще тест G чи Пірсон чи-квадрат. Розмір вибірки - сотні, але кількість низьких клітин. Як зазначено на сторінці Вікіпедії , наближення до розподілу chi-квадратиком краще для G-тесту, ніж для тесту Хі-квадрата Пірсона. Але я використовую моделювання Монте-Карло для обчислення р-значення, …

10 chi-squared  p-value  monte-carlo  contingency-tables 

Я перевіряю незалежність двох змінних, A і B, стратифікованих C. A і B є бінарними змінними, а C - категоричними (5 значень). Здійснюючи точний тест Фішера на А і В (всі страти разом), я отримую: ## (B) ## (A) FALSE TRUE ## FALSE 1841 85 ## TRUE 915 74 OR: …

10 categorical-data  interpretation  inference  contingency-tables  fishers-exact 

У мене є GLMM форми: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Під час використання drop1(model, test="Chi")я отримую інші результати, ніж якщо я використовую Anova(model, type="III")з автомобільного пакета або summary(model). Ці два останні дають однакові відповіді. Використовуючи купу сфабрикованих даних, я виявив, що …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Я порівнюю дві групи мутантів, кожна з яких може мати лише один з 21 різних фенотипів. Я хотів би побачити, чи розподіл цих результатів подібний між двома групами. Я знайшов онлайн-тест, який розраховує "тест-квадрат на рівність розподілів" і дає мені певні результати. Однак у мене в цій таблиці досить багато …

10 distributions  chi-squared  contingency-tables 

Подано випадків раку легені та відповідних контрольних груп (без раку легенів) (відповідність за віком, статтю тощо). Щоб спробувати знайти докази між впливом куріння на рак легенів, я використав точний тест Фішера на таблиці непередбачених ситуацій. Це, однак, не враховувало, що органи управління та справи відповідали збігу. 404040404040 Тож я задумався, …

9 contingency-tables  fishers-exact  paired-data  mcnemar-test 

Я працюю над прикладами в аналізі даних Doing Bayesian Kruske , зокрема експоненціальної пуассонової ANOVA в гл. 22, який він подає як альтернативу часто-часто-тестовим тестам незалежності для таблиць на випадок надзвичайних ситуацій. Я бачу, як ми отримуємо інформацію про взаємодії, які трапляються більш-менш часто, ніж можна було б очікувати, якби …

9 r  bayesian  effect-size  contingency-tables 

У мене є набір даних з двома категоричними номінальними змінними (обидві з 5 категоріями). Мені хотілося б знати, чи (і як) мені вдається виявити потенційні кореляції між категоріями цих двох змінних. Іншими словами, чи, наприклад, результати категорії в змінній 1 показують сильну кореляцію з конкретною категорією у змінній 2. Оскільки …

9 correlation  residuals  contingency-tables  categorical-data